HPC e Dinamica Molecolare
NUMTA 2019: uno studio sulle prestazioni di dinamica molecolare con la moderna architettura informatica
Un compito molto importante della biologia chimica è quello di scoprire il meccanismo che regola il riconoscimento e il legame tra le proteine. Nonostante la semplicità del modello basato su ligando, ci sono ancora molti dubbi sull’argomento. Avere strumenti di calcolo adeguati è essenziale per risolvere questa sfida che la scienza ci mette davanti.
I nostri ingegneri chimici e fisici hanno partecipato a uno studio in collaborazione con l’Università di Pavia, eseguendo simulazioni di Dinamica Molecolare e utilizzando il pacchetto GROMACS su due diverse piattaforme: un cluster basato su processore ARM ThunderX2 e un sistema single node Intel. Questo studio è stato fatto nell’ambito della 3a Conferenza Internazionale NUMTA (Numerical Computations: Theory and Algorythms) organizzata dall’Università della Calabria.
